台南县污水下水道系统目前仅有柳营乡进行了动工建设，但污水处理厂尚未与家庭污水管线连接，所以至今台南县污水下水道接管情况仍然不理想，家庭污水大多未经处理就直接排入水沟，流入溪流，使得河川污染日趋严重。　

　　台南县当局环保主管部门目前暂以推动小型的人工湿地来示范家庭污水的净化处理。工务主管部门虽有心推动污水下水道计划，但碍于财政困难，每个乡、镇、市估计都要新台币数十亿元，而台湾当局难以金援，再加上用地取得困难，使得污水下水道系统建设困难。　

　　据台南县工务主管部门人员指出，目前柳营乡污水处理厂已快完成，只是还未与家庭住户接管，官田乡每日产生污水不超过一万吨，已有经费可执行，至于归仁、佳里和永康等三个地区，每日产生的污水量超过一万吨以上，则列入“挑战2008计划”，预算虽尚未获有关部门通过，但台湾当局营建主管部门已要求台南县当局依照有关规定，尽快展开先期规划，包括招商计划、财务分析等，委外办理，希望通过民间参与来加快污水下水道的兴建工程。　

　　台南县工务主管部门人员也表示，台湾省污水下水道的用户接管普及率仅达10％，而污水下水道是现代化的重要指标，但当局财政又难以负担，所以才拟引进民间资金、技术及效率来参与，希望能带动污水下水道相关产业蓬勃发展。　

　　由于台湾当局已决定由民间参与污水下水道工程，因此台南县当局推动的佳里、仁德和永康等三项污水下水道工程全部纳入BOT项目。连日来，该县工务主管部门正在研拟相关的招标文件，希望11月初能上网公告，遴选出专业的规划团队统筹办理污水下水道的先期规划。　

　　至于招商期程，台湾当局规定该县归仁和佳里两个地区最迟要在2006年底完成BOT的招商签约，永康地区则要在2007年底要完成签约。